Analyse d'images

Analyses d'images

Consulter l'ensemble des résultats analyse d'image :

  • Logiciel de visualisation et d'analyse d'image 3D AMIRA de chez FEI (maintenant commercialisé par Thermofisher), localisé sur la cellule APEX (Nantes)
  • contact : Laurence Dubreil
  • Logiciel de visualisation et d'analyse 3D AMIRA 3.1 de chez FEI (maintenant commercialisé par Thermofisher), localisé sur la plateforme MIMA2 (Jouy-en-Josas). Version ancienne non renouvelée
  • contact : Pierre Adenot
  • Logiciel d'analyse d'images (dont déconvolution) Huygens de chez Scientifique Volume Imaging, localisé sur la cellule APEX (Nantes)
  • contact : Laurence Dubreil
  • Logiciel d'analyse d'image ImageJ (open source), localisé sur la plateforme PHIV (Montpellier)
  • Utilisé pour le comptage, les mesures,... Développement de plugins spécifiques
  • contact : Matthieu Dejean
  • Logiciels d'analyse d'images ImageJ/Fiji (open source), localisé à l'Observatoire du Végétal OV-Cytologie/Imagerie (Versailles-Grignon)
  • Utilisé notamment pour la co-localisation, le traitement de stack, la segmentation, 3D…
  • contact : Lionel Gissot
  • Logiciel de visualisation 3D et d'analyse d'image IMARIS, de chez Bitplane (désormais commercialisé par Orxford Instrument), localisé sur la plateforme MIMA2 (Jouy-en-Josas)
  • Équipé des modules additionnels suivant : Filament Tracer, Time-Lapse, Imaris Xtensions, Colocalization, Vantage.
  • contact : Pierre Adenot
  • Logiciel de visualisation 3D et d'analyse d'image IMARIS, de chez Bitplane (désormais commercialisé par Orxford Instrument), localisé sur la plateforme PHIV (Montpellier)
  • Utilisé pour les reconstruction 3D et la segmentation
  • contact : Matthieu Dejean
  • Logiciel de visualisation 3D/4D et d'analyse d'images Imaris de chez Bitplane (désormais commercialisé par Orxford Instrument), localisé à l'Observatoire du Végétal OV-Cytologie/Imagerie (Versailles-Grignon)
  • Équipé de modules permettant de suivre les objets dans le temps et l'espace
  • contact : Lionel Gissot
  • Logiciel d'analyse d'images inForm de chez Perkin Elmer, localisé sur la cellule APEX (Nantes)
  • Analyse d'image multi spectrale acquise sur la station Mantra
  • contact : Laurence Dubreil‎
  • Logiciel d'acquisition et d'analyse d'images Leica Application Suite X. 3.5.5.19976 de chez Leica, localisé localisé à l'Observatoire du Végétal OV-Cytologie/Imagerie (Versailles-Grignon)
  • Compatible avec les acquisition obtenues sur tous les microscopes Leica.
  • contact : Lionel Gissot
  • Logiciel d'analyse d'images histologiques MERCATOR, de chez Explora Nova, localisé sur la plateforme MIMA2 (Jouy-en-Josas)
  • Utilisé pour la quantification des marquages immunohistochimiques
  • contact : Pierre Adenot
  • Logiciel de visualisation, gestion et analyse d'images de microscopie OMERO (open source), localisé sur la plateforme PHIV (Montpellier)
  • contact : Matthieu Dejean
  • Logiciel d'analyse d'images MorphoGraphX (open source), localisé à l'Observatoire du Végétal OV-Cytologie/Imagerie (Versailles-Grignon)
  • Utilisé pour les analyses de la forme de l'organe et de la cellule, de la croissance, la quantification de fluorescence, la localisation des protéines...           
  • contact : Lionel Gissot
  • Logiciel d'analyse d'images (dont déconvolution) Nis-Element de chez Nikon, localisé sur la cellule APEX (Nantes). Utilisé pour l'histomorphométrie, la visualisation 3D et la déconvolution
  • contact : Laurence Dubreil
  • Logiciel client-serveur pour la visualisation, la gestion et l'analyse d'images de microscopie OMERO (open source), localisé sur la plateforme PHIV (Montpellier)
  • contact : Matthieu Dejean
  • Logiciel d'acquisition et d'analyse d'images ZEN 2.3 Blue de chez Zeiss, localisé sur le plateau technique IMAC (Angers)
  • contact : Aurélia Rolland
  • Logiciels d'acquisition et d'analyse d'images ZEN Black 2.3 SP1 et ZEN Bleu 2.3 (Zen Desk/Zen Lite) de chez Zeiss Microscopy, localisé à l'Observatoire du Végétal OV-Cytologie/Imagerie (Versailles-Grignon)
  • Logiciel compatible avec les acquisitions obtenus sur tous les microscopes Zeiss. Fichier *.czi
  • contact : Lionel Gissot

Date de modification : 25 janvier 2024 | Date de création : 25 septembre 2020 | Rédaction : Camille Rivard